Según el resultado del monitoreo de calidad de agua de la parte alta de la cuenca del río Huallaga, desarrollado en diciembre del año pasado, existiría presencia de sólidos suspendidos totales y metales como el plomo, zinc y cobre en sus aguas, debido a la existencia del botadero de Rumiallana  en Cerro de Pasco (Pasco), y de actividades mineras que dejaron pasivos, y que no están bien desarrolladas.

De acuerdo a los resultados de los parámetros de campo y los análisis de las muestras de agua, su calidad en la parte alta del río Huallaga y tributarios son de naturaleza neutra, con presencia de coliformes termotolerantes y nitrógeno amoniacal, que superan los Estándares de Calidad Ambiental (ECA) Agua. Todo esto se debe a las descargas de aguas residuales domésticas, siendo más afectados los ríos Huallaga, Huertas, Tulumayo, Aucayacu, Monzón, y Lomas Largas.